Las diferencias sistémicas, evitables, predecibles e injustas en el acceso, el tratamiento y los resultados entre individuos y entre poblaciones deberían ser particularmente preocupantes para quienes mejoran la calidad. A este tipo de diferencias se les suele denominar desigualdades o disparidades.

Las desigualdades son el peor tipo de variación no deseada en un sistema: variación vinculada a la complicada historia y realidad del racismo, el clasismo, el sexismo, el capacitismo, la discriminación por edad y otras formas de opresión. Los mejoradores de la calidad tienen un papel que desempeñar y herramientas que utilizar en los sistemas de atención médica y las comunidades para poner fin a las desigualdades.