Diferenças sistêmicas, evitáveis, previsíveis e injustas em acesso, tratamento e resultados entre indivíduos e entre populações devem ser particularmente preocupantes para os melhoradores de qualidade. Esses tipos de diferenças são frequentemente chamados de desigualdades ou disparidades.

As desigualdades são o pior tipo de variação indesejada em um sistema — variação ligada à história e realidade complicadas do racismo, classismo, sexismo, capacitismo, idade e outras formas de opressão. Os melhoradores de qualidade têm um papel a desempenhar e ferramentas a usar em sistemas de saúde e comunidades para acabar com as desigualdades.